El formato de remisión si desglosa el impuesto de IEPS por no ser un documento fiscal, aún y cuando el cliente no sea sujeto de IEPS.
Lo que puedes hacer y sería más fácil, es usar el formato de factura para usarlo como remisión haciéndole los cambios necesarios.
Uno de ellos  sería desactivar la validación según la modalidad de facturación en el formato de la factura como se muestra en la imágen:
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con esto ya podrás usar este formato como remisión para que el ieps se integre en el precio cuando el cliente no sea sujeto.